1. 遵循的规范不同
RequireJS 遵循的是 Modules/AMD 规范。
SeaJS 遵循的是 Mdoules/Wrappings 规范的 define 形式。
AMD 规范在 CommonJS 社区争议很大，规范里太多 RequireJS 的影子。社区里不少人反感 RequireJS 打着 CommonJS 的口号，甚至建议 AMD 自立门户，比如最近的这篇讨论：Split off AMD?
从这两个规范本身来说，Modules/Wrappings 规范更简洁优雅，不信的话，你读读它们各自的描述就清楚。
2. factory 的执行时机不同
在 RequireJS 里，模块有多种书写格式，推荐的是：
define(["./a", "./b"], function(a, b) {
a.doSomething();
b.doSomething();
});
在 SeaJS 里，模块只有一种书写格式：
define(function(require, exports, module) {
require("./a").doSomething();
require("./b").doSomething();
});
SeaJS 的模块书写格式，RequireJS 也支持。为了便于讨论，我们称呼 define 方法中的 function 参数为模块的 factory. 无论是在 RequireJS 还是 SeaJS 里，在执行 factory 之前，都会确保依赖的模块已经下载好：
/* a.js */
define(factory);
/* b.js */
define(factory);
/* c.js */
define(['./a', './b'], factory);
每个模块都有自己的 factory. 在 AMD 的书写格式下，上面例子中，模块 c 的 factory 在执行时，会接收 a 和 b 两个参数。这意味着，c 依赖的所有模块，都是在一开始就得执行好，即便有可能不需要执行，比如：
define(function(require) {
// BEGIN
if(some_condition) {
require('./a').doSomething();
} else {
require('./b').soSomething();
}
// END
});
在 AMD 规范里，在 BEGIN 处，a 和 b 的 factory 都已经执行好。在 Wrappings 规范里，在 BEGIN 处，a 和 b 的 factory 还没未执行，在 END 处时，根据条件，只会执行其中一个。
可以看出，Wrappings 规范更“懒”，更节省 CPU. 更符合 nodejs 等环境下的使用习惯。
AMD 规范只所以采用提前执行，可以参考作者的说明：Standards and proposals for JavaScript Modules and jQuery, 提到了两点理由，但并不被社区认可。我个人觉得这是一种权衡，但是是一种糟糕的权衡，破坏了与 Modules/1.0 规范的和谐性。有兴趣的可以搜索 Google Groups, 有相当多的讨论。
Wrappings 规范则尽可能的保留了 Modules/1.0 规范中的习惯。权衡点在于，对于条件语句中 require：
if(true) {
require('./a').doSomething();
} else {
require('./b').soSomething();
}
在 node 等环境中，能直接同步读取文件，可以做到只加载和执行模块 a, 不加载模块 b. 但在浏览器端，要实现这点，很困难（可以通过类似 Jscex 的方式来实现，但复杂度急增）。面对现实，目前基本所有浏览器端的 loader, 都是把依赖的模块都下载下来。从打包部署的角度考虑，这样做并不会对性能造成影响，反而能让不同条件分支，共享同一缓存。Wrappings 规范的提前下载和延迟执行，是一种合理的权衡。
3. 设计理念不同
如果你用过 RequireJS, 会知道：require 方法极其灵活，比如下面这些：
require(‘a’) — gets exports of module a
require(['a']) — fetch module a according to module name scheme
require(['a.js']) — fetch a.js directly relative to current page
require({…}) — set loader config
稍微有点变化，做的事情就不一样，个人很不喜欢，社区里也有不少人讨厌这种风格。
在 SeaJS 里，API 的设计理念是：
保持简单，职责单一。
遵守规范，但不拘泥。
适度灵活。
SeaJS 的公共 API 只有 8 个：速查手册, 职责很清晰，简单明了。
不拘泥规范，大家可以看到，SeaJS 里并没有采用 Modules/Wrappings 规范里的 module.declare. 这是因为：
module.declare(function(require, exports, module) {
module.id // 这是参数 module
});
module.declare(function(require, exports) {
module.id // 这是全局 module
});
显然，module.declare 导致 module 变量和 this 一样，随着环境的变化而变化。对于新手来说，这会带来迷惑。不如直接引入 define 来得简洁明了。随着 RequireJS 的推广，大家对 define 的接受程度也更高，更容易被理解。还有一个好处：使得 SeaJS 的模块，理论上讲，可以直接运行于 RequireJS 上。
适度灵活，举个例子：
seajs.use("./a"); // 加载一个模块
seajs.use(["./a", "./b"]); // 加载多个模块
4. 聚焦点有差异
SeaJS 从一开始，到现在，都是 focus on web, 努力成为浏览器端的模块加载器。sea.js 源码里，只有和浏览器相关的代码，不像 requirejs 一样，牵三挂四，有为了能在 Rhino 和 node 下运行的代码，甚至还有为了与 jQuery 集成的代码。聚焦的好处之一是，能减少文件大小：
SeaJS 目前的大小是：3.2K (gzip)
RequireJS 的大小是：5.4K (gzip)
seajs 的源码，目前是分多个文件开发的，每个文件都很聚焦，有完善的测试用例。requirejs 目前依旧是一个大文件，不利于维护。
5. 最后，还是理念不一样
RequireJS 有一系列插件，功能很强大，但破坏了模块加载器的纯粹性，个人觉得不妥。
SeaJS 则努力保持简单，追求简洁之美。除非必要，勿增实体。在功能上，SeaJS 有个优势是，支持 CSS 模块的加载。RequireJS 因为技术原因，目前版本尚未实现。
最后的最后
根据实际需求选择就好，关键是要养成模块化开发的好习惯。
收藏、分享这篇文章!